Bioperl Notes

在Windows下安裝Bioperl
一般用 ActivePerl 安裝，是一種PPM(Perl Package Manager)，
重點是在模組的載入方法!!
直接在命令列模式輸入PPM執行，會出現一個Perl Package Manager視窗
點選「Edit」>「Preferences」>「Repositories」 輸入新名稱
Location輸入框裡輸入一個連結

例如:
The University of Winnipeg's 5.8 PPM repository
http://theoryx5.uwinnipeg.ca/ppms/package.lst
A repository of Bioperl packages
http://bioperl.org/DIST
Roth Consulting's package repository
http://www.roth.net/perl/packages/
the "Bribes de Perl" (Scraps of Perl) repository (en Français et Anglais)
http://www.bribes.org/perl/ppm/

點選「Add」即可


在 Mac下安裝Bioperl
1.用 port
2.在 CPAN 載回
>> sudo perl Makefile.PL
>>./Build test
>>./Build install

其他參考
1.http://wenching520.pixnet.net/blog/post/16682805
2.http://liucheng.name/765/
3.推薦例子: Bioperl:使用和解析 BLAST http://liucheng.name/400/