port Tk problem ?

step_01. port install Tk --> error !! not for root ~~;

step_02. sudo port install Tk --> look fine, but run perl code, " can t locate tk pm in @inc";

step_03. sudo port install p5-tk --> install this one; look fine => success !!

Next time, use " sudo port -d install p5-tk";

-d enabled debugging lines to show on the screen, which can give you hints on how to solve problems

Cluster Note: code source link

All download to the folder of k-mean

0. Wiki link

1. Practical Data Mining with Perl -- Link

2. k-Means Clustering demo program with Tk --> link

3.CPAN Algorithm::KMeans --> Link

4. Matlab cluster source code --> link1link2

5. C code --> link

6. Basic --> Link

又多了一首心境相符的歌曲

除了之前的 Sorry 又多了一首心境相符的歌曲

賢知之歌

日が暮れて　どこからか
（太陽下山　不知從何方）
カレーの匂いがしてる
（傳來了咖哩的香味）

どれだけ歩いたら　家にたどりつけるかな
（不知道還要走多久　才能回到家啊）

僕のお気に入りの　肉屋のコロッケは
（我最喜歡的肉品店的炸可樂餅）
いつもどおりの味で　待っててくれるかな
（是不是還是用老味道　在等著我啊）

地球の上に夜が来る
（夜晚降臨地球）
僕は今　家路を急いでる
（而我正在趕回家的路上）

来年のことを言うと　鬼が笑うっていうなら
（說到明年的事　如果魔鬼想要笑的話）
笑いたいだけ　笑わせとけばいい
（那就讓他　盡情的笑吧）

僕は言い続けるよ　5年先10年先のことを
（我會一直說下去　不管是五年還是十年）
50年後もこうして　キミといるだろうと
（五十年後也是這樣　跟你在一起）

地球の上に夜が来る
（夜晚降臨地球）
僕は今　家路を急いでる
（而我正在趕回家的路上）

雨が降っても　嵐が来ても
（不管是下雨　不管是風暴）
やりが降ろうとも　みんな家に帰ろう
（不管是槍林彈雨也一樣　我不會讓他阻撓）

邪魔させない　誰にも止める権利はない
（大家回家　不論是誰都沒有這個權力）

地球の上に夜が来る
（夜晚降臨地球）
僕は今　家路を急いでる
（而我正在趕回家的路上）

世界中に夜が来る
（全世界都是黑夜）
世界中が家路を急ぐ
（全世界的人　都在回家的路上）

こんな毎日が　キミのまわりで
（這樣的每一天　都在你的身邊）
ずっと　ずっと　続きますように
（希望這種日子可以　一直持續下去）

Perl "Hash of hash" 真是亂中加亂

我真是老了 一兩個禮拜沒用 又還給駱駝老兄了
只好寫在這裡 以免忘記又再找

Book : Programing Perl (Link here)

9.4. Hashes of Hashes

建立方法: 雙迴圈 use the following two loops:



while ( <> ) {
next unless s/^(.*?):\s*//;
$who = $1;
for $field ( split ) {
($key, $value) = split /=/, $field;
$HoH{$who}{$key} = $value;
}
}

while ( <> ) {
next unless s/^(.*?):\s*//;
$who = $1;
$rec = {};
$HoH{$who} = $rec;
for $field ( split ) {
($key, $value) = split /=/, $field;
$rec->{$key} = $value;
}
}

PDB 相關網站

1.RCSB__
2.PDBj__
3.PDBe__
4.PDBselect__
5.PDB-REPRDB__
6.PISCES__


Nature 也來參一腳 ?

PSI Structural Biology Knowledgebase__

Mac port 同感！

寫得真好 - 隨便忘，隨便記。記了就忘，忘了再記。但事實是我都懶得記…
http://blog.jeffean.net/2010/08/macport.html

我發現我也是
也記一下囉
MacPorts官方網站：http://www.macports.org/


port -d selfupdate # 升級 macport
port upgrade outdated # 升級所有軟體
port list # 列出所有軟體

port install xxx # 安裝 xxx 軟體
port installed # 列出已經安裝軟體清單

port search xxx # 尋找與 xxx 條件相符的軟體
port info xxx # 列出與 xxx 相關的資訊與需求軟體

安裝時記得用管理員權限
macport 預設安裝路徑在 /opt/local/ 下面

記得把 /opt/local/bin or /opt/local/sbin 加到PATH
指令如下: export PATH=/opt/local/bin:/opt/local/sbin:$PATH
這是暫時性
如果有需要就把它加入 ~/.profile 這個檔案裡
1. vim ~/.profile
2. 開啟的文件檔裡加上 export PATH 那行之後
3. 存檔
4. 重開 terminal



for example:

mac port install gromacs 4.5.3

path : /opt/local/lib/gromacs/bin

設定Mac OS X 10.5.x的PATH環境變數

1.打開終端機

2.執行 sudo vi /etc/paths

需輸入你的密碼

3.將要加入的路徑存入/etc/paths後存檔 --

設定的目錄必須用符號“：”來加以區隔開來。

4.Logout 再 Login , PATH就生效了.


練習 >> echo $PATH # 列出 PATH 的環境變數